I benefici provenienti dall'agricoltura biologica sono principalmente quelli a favore dell'ambiente e quelli a favore degli animali, poiché si impegna a rispettare il più possibile le caratteristiche specifiche della zona, che viene messa a colture, e  le esigenze di ogni specie animale degli allevamenti.

Per quanto riguarda l'ambiente, viene innanzitutto considerato il tipo di terreno dal quale consegue la scelta del tipo di coltura. A questo punto, uno degli obiettivi principali sarà quello di mantenere le caratteristiche originarie, possibilmente migliorarle proteggendo il terreno dalle erosioni e dalla perdita di preziosi minerali e organismi. Questo grazie all'utilizzo di fertilizzanti organici, di mezzi di coltivazione meccanici, del sovescio, di un attento utilizzo delle acque e del rispetto dei ritmi naturali del terreno. Anche la lotta contro i parassiti e le piante infestanti può trasformarsi in uno strumento di arricchimento del terreno: si cerca di creare condizioni sfavorevoli al proliferare dei parassiti, ma favorevoli agli organismi in grado di comabatterli e si scelgono varietà di piante naturalmente più resistenti.

Un altro elemento essenziale all'agricoltura, ma anche alla salute di tutto l'ambiente, è l'acqua. Consapevole del valore di questa risorsa, la coltivazione biologica la utilizza con grande attenzione. Si cerca, infatti, di mantenere i corsi d'acqua (ruscelli, paludi ecc.) presenti nella zona e si attuano tutti gli accorgimenti possibili per usarne la minor quantità possibile; per esempio, vengono piantate siepi e  piante che combattono l'erosione del terreno e rendono necessaria una minor quantità di acqua per mantenere il terreno fertile. Inoltre, evitando di usare sostanze chimiche nelle pratiche agricole, si contribuisce a combattere l'inquinamento idrico.